Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms