Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLR3CQ9BUI4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR3CQ9BUI4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms