Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCM2Q9BSQ5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms