Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD2Q9BSE4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERPUD2Q9BSE4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERPUD2Q9BSE4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERPUD2Q9BSE4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERPUD2Q9BSE4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERPUD2Q9BSE4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERPUD2Q9BSE4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERPUD2Q9BSE4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERPUD2Q9BSE4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERPUD2Q9BSE4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERPUD2Q9BSE4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERPUD2Q9BSE4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERPUD2Q9BSE4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERPUD2Q9BSE4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERPUD2Q9BSE4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERPUD2Q9BSE4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms