Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ECSITQ9BQ95 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms