Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms