Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NIPSNAP1Q9BPW8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIPSNAP1Q9BPW8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIPSNAP1Q9BPW8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIPSNAP1Q9BPW8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIPSNAP1Q9BPW8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIPSNAP1Q9BPW8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIPSNAP1Q9BPW8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NIPSNAP1Q9BPW8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms