Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms