Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms