Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HHIPL1Q96JK4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPL1Q96JK4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms