Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms