Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms