Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAF2Q96CS3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms