Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms