Protein–RNA interactions for Protein: Q8NET4

RTL9, Retrotransposon Gag-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL9Q8NET4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RTL9Q8NET4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL9Q8NET4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL9Q8NET4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL9Q8NET4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL9Q8NET4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL9Q8NET4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL9Q8NET4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL9Q8NET4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL9Q8NET4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL9Q8NET4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL9Q8NET4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTL9Q8NET4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms