Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC21AQ8NDW8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC21AQ8NDW8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC21AQ8NDW8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC21AQ8NDW8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC21AQ8NDW8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC21AQ8NDW8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC21AQ8NDW8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC21AQ8NDW8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC21AQ8NDW8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC21AQ8NDW8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC21AQ8NDW8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC21AQ8NDW8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC21AQ8NDW8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC21AQ8NDW8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC21AQ8NDW8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC21AQ8NDW8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC21AQ8NDW8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC21AQ8NDW8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC21AQ8NDW8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC21AQ8NDW8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC21AQ8NDW8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC21AQ8NDW8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC21AQ8NDW8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC21AQ8NDW8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC21AQ8NDW8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
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