Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms