Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms