Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG4DQ86TL0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms