Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF554Q86TJ5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF554Q86TJ5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms