Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT27Q7Z3Y8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT27Q7Z3Y8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms