Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDPD3Q7L5L3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms