Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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