Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZBED9Q6R2W3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED9Q6R2W3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms