Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL35Q6PF15 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms