Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMER1Q5JTC6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
AMER1Q5JTC6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
AMER1Q5JTC6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
AMER1Q5JTC6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
AMER1Q5JTC6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
AMER1Q5JTC6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
AMER1Q5JTC6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMER1Q5JTC6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMER1Q5JTC6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMER1Q5JTC6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMER1Q5JTC6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMER1Q5JTC6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMER1Q5JTC6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMER1Q5JTC6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMER1Q5JTC6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMER1Q5JTC6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMER1Q5JTC6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMER1Q5JTC6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMER1Q5JTC6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMER1Q5JTC6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMER1Q5JTC6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMER1Q5JTC6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMER1Q5JTC6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMER1Q5JTC6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMER1Q5JTC6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms