Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms