Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms