Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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