Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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