Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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