Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NECTIN1Q15223 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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