Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERPUD1Q15011 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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