Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCAPHQ15003 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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