Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB39AQ14964 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms