Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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