Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSHL1Q14406 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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