Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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SPIDRQ14159 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPIDRQ14159 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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SPIDRQ14159 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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SPIDRQ14159 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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