Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBA3CQ13748 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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