Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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