Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CUL4AQ13619 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL4AQ13619 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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