Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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C1orf61Q13536 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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C1orf61Q13536 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1orf61Q13536 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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