Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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