Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SP140Q13342 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP140Q13342 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP140Q13342 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP140Q13342 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP140Q13342 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP140Q13342 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP140Q13342 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP140Q13342 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP140Q13342 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP140Q13342 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SP140Q13342 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP140Q13342 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP140Q13342 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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SP140Q13342 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP140Q13342 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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SP140Q13342 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP140Q13342 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP140Q13342 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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SP140Q13342 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP140Q13342 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP140Q13342 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP140Q13342 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SP140Q13342 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SP140Q13342 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SP140Q13342 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SP140Q13342 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SP140Q13342 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SP140Q13342 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SP140Q13342 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SP140Q13342 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SP140Q13342 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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