Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF3Q13114 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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