Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PRDM2Q13029 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
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