Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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