Protein–RNA interactions for Protein: Q09013

DMPK, Myotonin-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMPKQ09013 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DMPKQ09013 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms