Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms