Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR3Q06889 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms